傅里叶质谱仪是用于化学、生物学等领域的分析仪器，可以应用在有机物分子量、生物大分子、蛋白质组学、蛋白鉴定、蛋白表达、蛋白定量、生物标记、翻译后修饰、药物代谢、代谢物鉴定、代谢物定量等研究分析方面。傅里叶离子回旋共振质谱仪具有高分辨率优势，傅里叶变换离子回旋共振质谱仪（FTICR-MS）是前者与计算机技术相结合的产物，也称为傅里叶变换质谱仪。
傅里叶变换质谱仪，是根据给定磁场中的离子回旋频率来测量离子质荷比的质谱分析仪。傅里叶变换质谱仪的工作原理是：离子在强磁场作用下以很小的轨道半径作圆周运动，此时离子的回旋频率与离子质量成反比，不产生可接收电流信号；施加电压，当强磁场频率与离子回旋频率相同时会产生共振现象，离子吸收射频能量，运动轨道半径增大，从而产生可被接收的电流信号。
自20世纪70年代中期傅里叶变换质谱仪问世以来，凭借优良性能，其应用市场得到迅速发展。傅里叶变换质谱仪具有分辨率高、灵敏度好、检测准确度高、数据采集速度快、可利用不同电离源、可进行多级质谱检测、定性能力极好等优点，在化学、生物学等高端科研领域具有重要作用，特别是在生物大分子、蛋白组学、代谢组学研究方面具有不可或缺性。
新思界
行业分析人士表示，傅里叶变换质谱仪功能强大，但仪器体积大、质量重，且产品价格高昂，维护费用昂贵，因此主要应用在高端科研领域，市场普及率有限。由于技术含量高，全球傅里叶变换质谱仪生产企业数量较少，领先企业主要集中在欧美地区。一直以来，我国仪器仪表行业高端市场竞争力不足，需求对外依赖度大，目前来看，我国质谱仪企业在傅里叶变换质谱仪研制领域核心技术掌握有限，未来还有较大进步空间。
