医疗器械直接或者间接接触人体，因此对其安全要求较高，消毒、灭菌显得尤为重要。根据感染的几率以及危险程度不同，给医疗器械进行消毒的方式也不同，因此我们可以给医疗器械分为三大类，关键性器械、半关键性器械、非关键性器械等。
对于关键性器械，如外科手术器械、内窥镜等需要在治疗中刺穿人体并和人体进行亲密接触的器械，给人体带来疾病的几率较高，因此需要进行严格的灭菌，通常会选择使用紫外线、远红外线、高温、臭氧等方式进行杀菌消毒。
对于仅仅对于人体皮肤进行接触的半关键器械，如呼吸麻醉机、体温计等，也需要采用严格的消毒方案，通常选择高效化学消毒剂或热力消毒方法进行消毒。
对于不和病人直接进行接触的非关键性医疗器械产品，如听诊器、氧气面罩等，通常会选择进行清洁，清洗，但当该类器械疑似被污染时，也需要通过含氯清洗消毒剂进行消毒处理。
在医疗器械消毒的产业的中游为消毒设备以及消毒产品。关于清洁设备，主要有手动清洁机、自动清洗机和超声波清洗机，其中自动清洗机是主流产品。消毒灭菌设备可分为高温灭菌法和低温灭菌法，其中高温灭菌法在临床中应用最为广泛，常见的有压力蒸汽灭菌法、快速蒸汽灭菌法。低温灭菌法主要采用环氧乙烷灭菌，是当前在临床中应用最多，对于灭菌物品损害最小，穿透力较强的方式。
根据新思界产业研究中心发布的
《2020-2025年医疗器械消毒行业风险投资态势及投融资策略指引报告》显示，近几年，随着全球发展国家医疗产业的快速发展，医疗设备需求的攀升，带动医疗器械消毒市场规模不断扩大，到2019年全球医疗器械消毒市场为33.1亿美元，在新冠疫情席卷全球的背景下，各国多于医疗器械消毒更为重视，因此促进医疗器械消毒行业的快速增长，预计到2024年全球医疗器械消毒市场规模将达到46.8亿美元以上，近五年的年复合增长率为7.2%。
从市场竞争方面来看，医疗器械消毒相关企业主要有STERIS、Getinge、Cantel Medical、新华医疗、北京白象新技术、连云港千樱医疗设备等，主要为医院提供消毒灭菌设备、感染控制解决方案、清洗消毒系统等。
医疗器械消毒产业目前尚未成熟，针对内窥镜等结构独特的产品无法达到100%的灭菌消毒。所以未来在医疗器械消毒领域，相关企业需要不断改进技术，提升消毒能力，而对于医院而言，需要对消毒医生进行规范化的培训，尽量降低交叉感染病例的发生。
新思界
产业分析人士表示，医疗器械消毒产业属于医疗行业的衍生产业，本身受重视程度较低，但受新冠疫情的影响，全球对于交叉感染的防治重视度提升，因而促进医疗器械消毒行业的快速发展。对于医院而言，医疗器械的重复使用是必然事件，未来随着手术机器人等产品的普及，医疗器械消毒设备以及产品市场需求将持续提升，医疗器械消毒行业发展前景较好。
