3CL蛋白酶（3CL pro）又称为主蛋白酶，属于蛋白酶PA家族的成员。3CL蛋白酶是冠状病毒复制所必须的酶，主要作用于病毒进入宿主细胞后的初始复制阶段。3CL蛋白酶是抗新冠病毒药物小分子药物研发的热门靶点之一，3CL蛋白酶抑制剂通过抑制3CL蛋白酶活性，阻止病毒自我复制。
SARS-CoV-2是导致COVID-19流行的主要病毒病原体，SARS-CoV-2病毒基因组蛋白分为非结构蛋白、结构蛋白以及辅助蛋白三类。3CL蛋白酶、Rdrp是目前全球新冠药物已验证的主要靶点，从成药角度来看，3CL蛋白酶在不同冠状病毒中保持结构上的高度保守性，且安全性、有效性高，因此，3CL蛋白酶被认为是最优研发路线，3CL蛋白酶抑制剂研发也日趋火热。
在疫情防控常态化发展背景下，新冠药物、疫苗研发热情高，新冠口服药因在生产、运输、储存、服用等方面具有明显优势，市场关注度较高。根据新思界产业研究中心发布的《
2022-2027年3CL蛋白酶抑制剂行业市场深度调研及投资前景预测分析报告》显示，目前辉瑞的Paxlovid是全球3CL蛋白酶靶点首个、也是最成功的新冠口服药，根据辉瑞季报显示，2022年Q1，Paxlovid销售额为14.7亿美元，2022年Q2，Paxlovid销售额达到81.0亿美元。
Paxlovid作为新冠口服药之一，先发优势显著，且最终临床数据优于RdRp抑制剂，目前，Paxlovid已在全球拥有超过40个上市许可，预计2022年全年，Paxlovid全球销售额将达到600.0亿美元以上。Paxlovid先发优势明显，但其也存在争议性，为抑制Paxlovid快速代谢，在临床上，Paxlovid需和代谢抑制剂ritonavir联用。
自COVID-19爆发以来，全球新冠药物研发热情高涨，在3CL蛋白酶抑制剂方面，全球在研药物有盐野义的S-217622、歌礼制药的ASC22、先声药业的SIM0417、众生药业的RAY003、云顶新耀的EDDC-2214、前沿生物的FB2001以及谷森医药的GS-00202等。目前来看，盐野义的S-217622研发进展较快，目前处于临床三期。我国3CL蛋白酶抑制剂在研药物多，但大部分药物都处于临床前阶段。
新思界
行业分析人士表示，3CL蛋白酶是抗新冠病毒药物研发热点靶点之一，在疫情防控常态化发展背景下，3CL蛋白酶抑制剂市场发展空间广阔。目前来看，辉瑞的Paxlovid在3CL蛋白酶抑制剂领域具有先发优势，但Paxlovid也存在争议性，未来随着技术进步，3CL蛋白酶抑制剂领域后来者居上也并非毫无机会。
