cDNA探针，一般为单链核酸分子，因此也称单链cDNA探针，是以互补于mRNA的DNA分子制作而成的探针，是核酸探针细分产品RNA探针的一种。
cDNA探针的制备过程可简单概括为，对相应的基因进行转录，获得mRNA，再利用逆转录酶，使mRNA经逆转录作用得到cDNA，cDNA经标记物标记后制备为探针。cDNA探针为单链，与目标基因碱基顺序互补，可杂交形成双链；在基因转录过程中，内含子序列会被剪切去除，因此cDNA探针不含内含子序列。
cDNA也可以从cDNA文库中克隆获得，可以克隆单链cDNA、双链cDNA。由于双链cDNA制备而成的双链cDNA探针，会使可以与目标核酸序列杂交结合的有效探针数量减少，降低了杂交效率，同时也降低了检测灵敏度，因此通常所说cDNA探针一般为单链cDNA探针。
经标记物标记的cDNA探针，与被测样品中的核酸分子进行杂交，若样品中含有与探针互补的核酸序列，二者可杂交形成双链，将未杂交的探针洗去，利用标记物的自显影或者发光特性进行检测，可以获得样品中是否含有与cDNA探针互补的目标核酸序列，以及目标核酸序列的含量与位置等信息。
根据新思界产业研究中心发布的
《2024-2028年cDNA探针行业深度市场调研及投资策略建议报告》显示，由于为单链核酸分子，且不含内含子序列，cDNA探针具有杂交反应敏感性高的优点，是理想的核酸探针产品，但制备难度较大，对其应用形成一定限制，目前主要应用于科研领域。但cDNA探针在检测领域也有发展空间，例如利用cDNA探针可以检测遗传性疾病DMD（假肥大型进行性肌营养不良）患者的基因缺失。
在全球范围内，cDNA探针提供商主要有德国默克集团（Merck KGaA）、德国Greiner Bio-One GmbH、日本Takara Bio、美国赛默飞世尔（ThermoFisher）、美国伯乐（Bio-Rad Laboratories）、美国Enzo Life Sciences、美国NEB、美国Sequenom、美国Roche Nimblegen、美国Cepheid、美国安捷伦（Agilent）、美国因美纳（Illumina）、美国Life Technologies Corporation、美国Affymetrix等。美国在全球cDNA探针市场中处于领先地位。
新思界
行业分析人士表示，广义上的生物探针包括核酸探针、抗体探针两种，其中，核酸探针为主流产品。核酸探针又包括DNA探针、RNA探针两种，其中，DNA探针占据主导地位，RNA探针应用占比较少。RNA探针包括单链cDNA探针、cRNA探针、寡核苷酸探针三种，各有优缺点。总的来看，cDNA探针市场需求小，但在科研领域拥有发展空间。
