空间多组学是一种综合性的研究方法，其能够在保持组织空间坐标的同时描绘组学信息。空间组学包括空间蛋白组学、空间转录组学、空间基因组学、空间代谢组学，通过整合多维度数据，空间多组学技术可以更全面、更准确的进行生物信息学分析。
传统组学如基因组学、蛋白质组学、转录组学等方法一般只能提供特定分子层面的信息，组织结构分布信息难以展示，空间多组学技术分辨率可达单细胞乃至亚细胞级别，填补了传统组学无法展示组织结构分布的空白。空间多组学结合了不同类型的空间组学技术，已成为生物系统空间组织、分子交互作用研究的强大工具。
近年来，基于其优势，空间多组学在肿瘤研究、潜在治疗靶点分析、药物研发、疾病诊断和预测、基础生命科学研究等领域应用越来越广泛。随着相关技术迭代，空间多组学应用前景将更加明朗。
根据新思界产业研究中心发布的《
2025-2029年空间多组学行业市场深度调研及投资前景预测分析报告》显示，近年来，空间多组学技术关注度不断提升。2022年，空间多组学技术被Nature列为年度七大突破性技术之一；2023年国家自然基金项目中空间多组学立项数不足10项，但资助金额近400万；2024年12月，第四届多组学科研与临床应用大会将在武汉举行。
空间转录组学是目前应用最为广泛的空间组学技术之一，根据原理不同，空间转录组学分为基于测序—添加barcode空间索引、基于成像—添加探针荧光信号两种。空间转录组学方法主要包括空间条形码方法、原位测序法技术、序列原位杂交法三种，目前空间条形码方法商业化程度最高。
近年来，国内外研究团队在空间多组学领域开展了大量深入研究，相关成果不断涌现，2024年以来，空间组学技术相关CNS论文已达500多篇。我国空间多组学相关专利有《一种基于光学磁粒子的空间多组学单分子成像系统和方法》、《基于多组学数据的细胞识别方法、装置、设备及存储介质》等。
新思界
行业分析人士表示，空间多组学技术研究热情正不断提升，全球布局企业逐渐增加，市场发展势头良好，包括10x Genomics、Bruker、Standard BioTools、Vizgen、Lunaphore、华大时空、德运康瑞、非因生物、菲诺维康生物、中科新生命、贝普奥等。但整体来看，空间多组学行业仍处于发展前期，目前仍存在流程复杂、成本高、标准化准则缺乏、高效的计算分析工具缺乏等问题。
