国内医药行业很多企业把代理模式、经销模式、控销模式、分销模式等叫作商业模式，其实这是营销模式，不是真正的商业模式。营销模式可以根据产品的不同进行个性化的变化或者修正，但商业模式一旦固定就很难短期改变。商业模式即为实现客户价值最大化，把能使企业运行的内外各要素整合起来，形成一个完整的、高效率的、具有独特核心竞争力的运行系统，并通过最优配置和组合的形式满足客户需求、实现客户价值，同时使企业运营系统达成持续赢利目标的整体解决方案。
制药企业的商业模式也有一些成功范例，较为典型的是广告拉动模式，比如哈药集团依靠广告营销树立起几个优秀的OTC品牌、仁和集团可立克、江中制药的健胃消食片等品牌。复星医药凭借投资运营模式把小药企做成了综合性集团公司，还有以新药研发为主的研发导向模式。制药企业的商业模式就是盈利模式，简单的说就是怎样盈利，而营销模式将要通过系列的营销体系搭建、渠道设计、终端管理、产品策划，销售团队建设等将商业模式具体实现，并形成经营业绩。商业模式决定了营销模式，没有好的商业模式或者有竞争性的商业模式，单靠营销驱动企业发展，是很难持久的。现在和未来的制药企业的竞争，不再是单一的产品竞争，而是商业模式之间的竞争。
国内也有一些很好的民营企业，通过自身商业模式的演进和升级，形成了自身的发展态势，成为医药行业的第一梯队。当年扬子江药业就是通过商业模式的改进，加以营销模式的体现，最终获得了巨大的成功。神威药业之前是一个小企业，如果单纯的依靠营销发展，估计现在也是小企业，但神威药业提出了专注现代中药的商业模式，于是才有了后来的五福心脑清等现在中药产品，并形成了很大的销量。康芝药业以前是个名不见经传的商业流通公司后来改制做制药业务，但品种繁多，竞争力弱化。康芝药业改变了发展模式，专注于儿童药的研发，经营和销售，于是有了跨越式的发展。
现在和未来的医药企业市场竞争中，营销不再是在战术层面的创新，而是商业模式的创新。比如仅仅是通过营销模式的改进、铺货、促销和人海战术等方式来想增加业绩，这种传统的制药企业经营思路是无法长久的，也容易被模仿，只有对商业模式进行创新才能获得最大的利润。现在的先声药业、康缘药业等，依靠研发驱动的商业模式在经历多年发展后，现在就获得很大的发展红利和政策性红利，这种具有竞争优势的商业模式是其他企业短期内难以模仿的。
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医药行业分析人士表示，制药企业如果还固守原来的商业模式或者还是没有自己的商业模式，就会在未来的市场竞争中逐渐失去现在的一些优势，更会丧失发展的先机。
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